人类窥见“生命天书”以来,科学家们已经发现了大量与癌症发生、发展相关的突变。然而,从发现这些“靶点”到开发出靶向药物,中间仍存在着巨大的鸿沟。研究人员首先需要借助实验室中的细胞工具来验证这些靶点,再开展药物发现与验证过程。
过去,已经沿用数十年的癌细胞系为癌症研究做出了巨大贡献,但它们通常以单层细胞形式在培养皿中生长,无法完全模拟原始肿瘤的三维结构和遗传特征。此外,当下的癌细胞系远不足以代表癌症的多样性,许多罕见癌症类型几乎是完全缺失的。
但来自国际数十个机构的研究人员联合在《自然》杂志发表了一项重磅研究,将早期癌症研究工具往前推动了一大步。研究团队成功开发了近700个源自患者肿瘤的新型癌症模型,这些模型不再局限于平面生长,而是具备模拟肿瘤组织、功能的三维结构。该模型更接近身体内部的肿瘤生存情况,能够为癌症研究提供更精准的启示。
2016年,“人类癌症模型计划”(Human Cancer Models Initiative)正式启动,该项目从参与研究的医院获取了超过2700份肿瘤样本。为了将样本转化为能够在实验室中长期存活的细胞工具,研究团队开发了专门的培养技术:使用特殊的生长培养基,并辅以三维支架结构,帮助细胞生长成球状的“类器官”。与传统的二维细胞系不同,类器官是嵌入在凝胶状结构中的三维细胞球,能够更真实地模拟原始组织的结构和功能。
研究团队最终获得了665个癌症模型,其中包括了一些罕见癌症类型,例如胆囊癌和小肠癌模型等。研究人员对每个模型进行了严格的验证,确保其RNA表达和表观遗传修饰与原始肿瘤细胞高度一致。结果显示,这些模型在DNA改变方面与原始肿瘤的相似度高达97.8%,在RNA表达上也达到了92%。研究指出,即使在实验室中培养一年甚至更长时间,这些模型依然能保留原始肿瘤的核心特征。
除此之外,研究人员还深入探究了极少数与原始肿瘤不完全一致的模型,并发现了三种偏离机制:一是模型中原本混杂的免疫细胞和基质细胞在培养过程中丢失了;二是肿瘤中某个不起眼的“小分支”细胞在培养皿中意外地反客为主,成为了生长主力;三是培养环境中的某些成分改变了细胞的表观遗传。这些发现,为后续的肿瘤模型构建提供了建设性提示。
研究还发现,模型构建时的培养液选择至关重要。例如,对于胶质母细胞瘤,使用名为“NSA”的特殊培养液,能很好地维持肿瘤细胞原有的基因表达状态;而换用其他培养液,细胞的特性就会发生漂移。
在另一篇同期发表的《自然》论文中,研究人员对300多个新模型进行了系统分析,成功识别出每个模型中的基因脆弱性,这些基因可能成为新药开发的靶点。这些信息已被整合到一个名为“癌症依赖性图谱”的数据集合中,该图谱现已包含超过2000种癌症类型的信息。
不过,研究人员也指出了新模型的局限性。例如,这些模型缺乏肿瘤微环境中的基质细胞和免疫细胞,因此在研究免疫治疗反应方面存在不足。不过,研究团队从25个来自接受过免疫治疗患者的模型中,发现了一些与耐药性相关的特征,这些模型或许能为研究肿瘤自身的耐药机制提供线索。
研究人员指出,新研究对癌症研究来说,将成为一个新的开始。随着更多癌症模型的开发和出现,我们离实现精准医疗的目标又前进了一步。
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