日前，风投公司Apple Tree Partners（ATP）宣布旗下的药物发现公司Deep Apple Therapeutics走出隐匿模式，并完成5200万美元的A轮融资。Deep Apple是一家通过人工智能（AI）产生模拟文库，以发现靶向高价值靶标的创新小分子疗法的生物科技公司。

根据新闻稿，凭借其结合冷冻电镜、深度学习和超大型分子对接筛选文库的强大发现引擎，Deep Apple可以在不到12个月的时间内——仅占行业标准时间的一小部分——完成从靶标识别到先导物优化，并能靶向通过传统发现方法无法触及的生物靶标信号。Deep Apple的发现引擎适用于广泛疾病领域，尤其适合针对完整膜蛋白的加速发现。该公司目前正在推进多个项目，开发重点是GPCR调节剂，应用于代谢紊乱、炎症、免疫学和内分泌疾病。

▲Deep Apple的药物发现引擎（图片来源：Depp Apple公司官网）

Deep Apple可在短短数小时内针对正构和变构结合位点对数十亿个可合成化合物进行计算机筛选，然后通过计算生成庞大的项目特异性虚拟库，发现具有理想可对接和可成药特性的专有化学型。实验室对所选虚拟化合物的测试结果会反馈到深度学习模型中，以不断提高预测性能。

▲Deep Apple的管线图（图片来源：Depp Apple公司官网）

Deep Apple的药物发现引擎建立在其学术联合创始人的研究基础上，包含斯坦福大学的Georgios Skiniotis博士，他是冷冻电镜和GPCR结构生物学的知名学者、虚拟筛选先驱加州大学旧金山分校（UCSF）的Brian Shoichet博士，以及UCSF的John Irwin博士，他是计算文库权威，创建了广泛使用的ZINC免费虚拟库，其中包含超过100亿种可合成化合物。