1961年Till JE， McCulloch EA用小鼠体内脾结节方法第一次证实了造血干细胞的存在。八十年代后，Weissman等多个实验室相继通过细胞表面标记分离出高度纯化的不同阶段的造血干祖细胞。在小鼠造血干细胞的研究中，造血干细胞的分离是通过细胞表面标记Lineage Sca-1c-kit或者细胞代谢方面的特性(侧群细胞)借助于流式细胞仪实现的。九十年代通过引入CD34这个细胞表面标记区分小鼠中长期造血干细胞和短期造血干细胞。进入二十一世纪后，基于SLAM家族分子（CD41，CD48和CD150）进一步富集造血干细胞，SLAM分子在造血干细胞的表达比较稳定，并且能够广泛的应用于各品系的实验小鼠。