近期,来自马萨诸塞大学医学院的研究人员通过研究开发了一种新型强大的工具,其可以揭示和人类疾病相关的遗传突变的特性,相关研究或可帮助科学家轻松有效地描述隐藏在复杂多基因疾病背后的基因组突变。
相关研究发表在国际杂志Cell上的一篇研究论文中。
基因调控网络(GRNS),包括转录因子(TFS)和监管座位控制发展和生理之间的相互作用。居住在基因组的非编码区的绝大部分的许多疾病相关的基因突变已经确定。
研究者Marian Walhout博士表示,截至目前为止我们仅可以在同一时间调查一种突变引发的疾病,而如今利用我们开发的平台就可以帮助我们在进行单一实验的情况下对成百上千种突变进行展现和分析,同时我们还可以绘制出一种新型的反应图谱,来可以组成强大的控制基因表达的网络来帮助确定基因突变如何引发多种人类疾病的发生。
全基因组关联分析(Genome Wide Association Study,GWAS)为基因组测序带来了革命性的进步,其同时也帮助科学家们定位到了和多种疾病发生相关的多种遗传突变,然而这些突变中有90%都不能编码蛋白的产生;DNA结合位点或转录因子的突变往往会通过破坏基因的调节来引发疾病,而这往往会导致靶向蛋白产生过多或不足,多种疾病,比如癌症、神经变性疾病、血液障碍及代谢性疾病就和异常的基因调节直接相关。
由GWAS鉴别出的大多数和疾病相关的突变实际上并不会改变蛋白质本身,而位于调节性区域的突变才会真正改变蛋白质的水平,于是研究者所面临的挑战就是鉴别这些突变如何以及为何引发疾病的发生。
早在2011年研究者就开发出了一种增强的,以基因为中心的酵母杂交实验,于是研究者在本文中就进行了涉及1000种转录因子以及100多种基因突变的数千种实验,最后在多种相关疾病中发现了DNA位点间相互作用的缺失及获得情况,同似乎还鉴别出了和基因表达改变相关的转录因子。
最后研究者Walhout说道,新型工具平台的开发帮助我们深入探寻了遗传突变及转录因子之间相互作用的差异,其在干扰基因调节网络上扮演着重要作用。
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