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Inntags:蛋白质无害标记的新工具
发布时间: 2015-09-21     来源: http://www.sciencedaily.com/

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生物医学研究所-IRB

摘要:

可以保留天然蛋白质功能和结构的蛋白标记新方法已经被发现。这项研究提出,使用两种命名为inntags植物蛋白抗原决定簇,作为蛋白质的物理性和功能性相互作用的研究中最无害的和稳定的标记工具。

正文


Inntags 是可提高蛋白质的研究效果的新工具。

来源:生物医学研究所-IRB供图

在巴塞罗那进行的一项研究揭示了一个可以保留天然蛋白质的功能和结构蛋白标记的新方法。发表在自然方法杂志上的这项研究,提出使用两种命名为inntags植物蛋白抗原决定簇,作为蛋白质的物理性和功能性相互作用的研究中最无害的和稳定的标记工具。

80年代初以来,蛋白质以及各种尺寸和形状的肽键一直用于许多不同的目的的蛋白质标记,从亲和纯化法到对整个生物体进行的基于荧光技术的显微镜检测。但是,现在使用的标记办法存在这样的风险,即蛋白质的天然功能可能由于与标记物质发生反应而被抵消或削弱。

这项研究是巴塞罗那生物分子学研究所领导,研究生物医学的计算生物学研究所(IRB巴塞罗那)、巴塞罗那超级计算中心和巴塞罗那大学参与的联合项目计算生物学联合项目,该项目已经分析了已知多肽的三维结构,来确定它们之中最合适用于标记目的的多肽。该项研究已经选择了作为抗原使用时仍表现出较强结构决定簇的最小蛋白质结构域,在与其他目标蛋白质结合时,它不会产生溶解性问题,不损害细胞的健全性和造成没有可检测功能和定位作用。

大系列的生物信息学工具首次用来扫描整个地球上的蛋白质组,来选择那些在理论上具有良好的标记特性的蛋白质。计算机人工处理以后,12号候选标记进行现场测试,发现他们都具有的优秀或卓越的性能。 Inntags保持其完整性、稳定性、在细胞提取物中的可溶性、扩散流动性和不引起的主要功能紊乱,通常使用的标记蛋白,例如MYC,、FLAGHA-do会引起这些功能紊乱。此外,该项测试显示过敏原Phl p2Heiven亚型2在对小白鼠成纤维细胞和海马神经元内的一系列蛋白质的免疫荧光和免疫共沉淀分析中的应用。

因为相比与普通标记蛋白,它们明显更加无害,所以inntags 可以是进行蛋白质组相互作用的研究、单分子水平上的蛋白质原位分析或当目标蛋白质不能提供明显的功能测定时可选择的工具。该项开发的技术将为研究人员在生物细胞学领域开辟新的可能性,因为其可以为他们提供一个更加巧妙、无偏差的方法来追踪在细胞内的蛋白质。

资料来源:

上述内容转载自生物医学-IRB研究所。

注意:材料的内容和篇幅可能被编辑。

参考期刊:

Maya V Georgieva, Galal Yahya, Laia Codó, Raúl Ortiz, Laura Teixidó, José Claros, Ricardo Jara, Mònica Jara, Antoni Iborra, Josep Lluís Gelpí, Carme Gallego, Modesto Orozco, Martí Aldea. Inntags: small self-structured epitopes for innocuous protein tagging. Nature Methods, 2015; DOI: 10.1038/nmeth.3556

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